Protein–RNA interactions for Protein: Q91WR6

Ginm1, Glycoprotein integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ginm1Q91WR6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ginm1Q91WR6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ginm1Q91WR6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ginm1Q91WR6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ginm1Q91WR6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ginm1Q91WR6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ginm1Q91WR6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ginm1Q91WR6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ginm1Q91WR6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ginm1Q91WR6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ginm1Q91WR6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ginm1Q91WR6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ginm1Q91WR6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ginm1Q91WR6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ginm1Q91WR6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ginm1Q91WR6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ginm1Q91WR6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ginm1Q91WR6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ginm1Q91WR6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ginm1Q91WR6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ginm1Q91WR6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ginm1Q91WR6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ginm1Q91WR6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ginm1Q91WR6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ginm1Q91WR6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ginm1Q91WR6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ginm1Q91WR6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ginm1Q91WR6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ginm1Q91WR6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ginm1Q91WR6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ginm1Q91WR6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ginm1Q91WR6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ginm1Q91WR6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ginm1Q91WR6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ginm1Q91WR6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ginm1Q91WR6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ginm1Q91WR6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ginm1Q91WR6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ginm1Q91WR6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ginm1Q91WR6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ginm1Q91WR6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ginm1Q91WR6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ginm1Q91WR6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ginm1Q91WR6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ginm1Q91WR6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ginm1Q91WR6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms