Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt79Q8VED5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt79Q8VED5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms