Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Shtn1Q8K2Q9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Shtn1Q8K2Q9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Shtn1Q8K2Q9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Shtn1Q8K2Q9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Shtn1Q8K2Q9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Shtn1Q8K2Q9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms