Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pacs1Q8K212 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacs1Q8K212 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacs1Q8K212 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacs1Q8K212 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacs1Q8K212 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacs1Q8K212 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacs1Q8K212 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacs1Q8K212 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacs1Q8K212 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacs1Q8K212 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacs1Q8K212 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacs1Q8K212 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacs1Q8K212 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacs1Q8K212 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacs1Q8K212 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacs1Q8K212 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacs1Q8K212 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pacs1Q8K212 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pacs1Q8K212 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms