Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc4a8Q8JZR6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slc4a8Q8JZR6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc4a8Q8JZR6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc4a8Q8JZR6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193 ms