Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps50Q8CI71 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps50Q8CI71 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps50Q8CI71 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms