Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGZ0

Cherp, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CherpQ8CGZ0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CherpQ8CGZ0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CherpQ8CGZ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CherpQ8CGZ0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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