Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc28aQ8CEI3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc28aQ8CEI3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms