Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp27Q8CEG8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp27Q8CEG8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp27Q8CEG8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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