Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdh13Q8CEE7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rdh13Q8CEE7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rdh13Q8CEE7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rdh13Q8CEE7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rdh13Q8CEE7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rdh13Q8CEE7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh13Q8CEE7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh13Q8CEE7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh13Q8CEE7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rdh13Q8CEE7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh13Q8CEE7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh13Q8CEE7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh13Q8CEE7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh13Q8CEE7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms