Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam228aQ8CDW1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam228aQ8CDW1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms