Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrif1Q8CDD9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lrif1Q8CDD9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrif1Q8CDD9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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