Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
E4f1Q8CCE9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E4f1Q8CCE9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
E4f1Q8CCE9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms