Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn5Q8CBA2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slfn5Q8CBA2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn5Q8CBA2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms