Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Spef2Q8C9J3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Spef2Q8C9J3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Spef2Q8C9J3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Spef2Q8C9J3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Spef2Q8C9J3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Spef2Q8C9J3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Spef2Q8C9J3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Spef2Q8C9J3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Spef2Q8C9J3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Spef2Q8C9J3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Spef2Q8C9J3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Spef2Q8C9J3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Spef2Q8C9J3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Spef2Q8C9J3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Spef2Q8C9J3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Spef2Q8C9J3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Spef2Q8C9J3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Spef2Q8C9J3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Spef2Q8C9J3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Spef2Q8C9J3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms