Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K3

Srsf12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf12Q8C8K3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srsf12Q8C8K3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf12Q8C8K3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms