Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bhlhe22Q8C6A8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlhe22Q8C6A8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bhlhe22Q8C6A8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms