Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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4933409G03RikQ8C5U0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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4933409G03RikQ8C5U0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933409G03RikQ8C5U0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933409G03RikQ8C5U0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933409G03RikQ8C5U0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933409G03RikQ8C5U0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933409G03RikQ8C5U0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933409G03RikQ8C5U0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
4933409G03RikQ8C5U0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933409G03RikQ8C5U0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933409G03RikQ8C5U0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933409G03RikQ8C5U0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933409G03RikQ8C5U0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933409G03RikQ8C5U0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
4933409G03RikQ8C5U0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933409G03RikQ8C5U0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933409G03RikQ8C5U0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
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