Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim35Q8C006 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim35Q8C006 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim35Q8C006 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188 ms