Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXN7

Ppm1k, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1kQ8BXN7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppm1kQ8BXN7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppm1kQ8BXN7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppm1kQ8BXN7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppm1kQ8BXN7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppm1kQ8BXN7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppm1kQ8BXN7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppm1kQ8BXN7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppm1kQ8BXN7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppm1kQ8BXN7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms