Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E330017A01RikQ8BU47 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E330017A01RikQ8BU47 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E330017A01RikQ8BU47 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E330017A01RikQ8BU47 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms