Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rd3Q8BRE0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rd3Q8BRE0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rd3Q8BRE0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 291.8 ms