Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem260Q8BMD6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem260Q8BMD6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmem260Q8BMD6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem260Q8BMD6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms