Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf3c2Q8BL74 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c2Q8BL74 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c2Q8BL74 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c2Q8BL74 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c2Q8BL74 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c2Q8BL74 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c2Q8BL74 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c2Q8BL74 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c2Q8BL74 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c2Q8BL74 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c2Q8BL74 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c2Q8BL74 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms