Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK06

Fbxo9, F-box only protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo9Q8BK06 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo9Q8BK06 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo9Q8BK06 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo9Q8BK06 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo9Q8BK06 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo9Q8BK06 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms