Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prox2Q8BII1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prox2Q8BII1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prox2Q8BII1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.1 ms