Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdca8Q8BHX3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdca8Q8BHX3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdca8Q8BHX3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms