Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M10.3Q85ZW6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M10.3Q85ZW6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M10.3Q85ZW6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M10.3Q85ZW6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M10.3Q85ZW6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M10.3Q85ZW6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M10.3Q85ZW6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M10.3Q85ZW6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M10.3Q85ZW6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M10.3Q85ZW6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M10.3Q85ZW6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M10.3Q85ZW6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-M10.3Q85ZW6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-M10.3Q85ZW6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M10.3Q85ZW6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M10.3Q85ZW6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M10.3Q85ZW6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M10.3Q85ZW6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M10.3Q85ZW6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M10.3Q85ZW6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms