Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc50Q810U5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc50Q810U5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc50Q810U5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc50Q810U5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms