Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc181Q80ZU5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc181Q80ZU5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms