Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Npm2Q80W85 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Npm2Q80W85 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Npm2Q80W85 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Npm2Q80W85 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Npm2Q80W85 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Npm2Q80W85 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Npm2Q80W85 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Npm2Q80W85 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Npm2Q80W85 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Npm2Q80W85 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Npm2Q80W85 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Npm2Q80W85 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Npm2Q80W85 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Npm2Q80W85 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Npm2Q80W85 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Npm2Q80W85 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Npm2Q80W85 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Npm2Q80W85 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Npm2Q80W85 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Npm2Q80W85 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Npm2Q80W85 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Npm2Q80W85 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Npm2Q80W85 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Npm2Q80W85 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Npm2Q80W85 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Npm2Q80W85 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Npm2Q80W85 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Npm2Q80W85 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Npm2Q80W85 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Npm2Q80W85 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Npm2Q80W85 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Npm2Q80W85 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Npm2Q80W85 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Npm2Q80W85 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Npm2Q80W85 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Npm2Q80W85 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Npm2Q80W85 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Npm2Q80W85 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Npm2Q80W85 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Npm2Q80W85 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Npm2Q80W85 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Npm2Q80W85 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Npm2Q80W85 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Npm2Q80W85 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Npm2Q80W85 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Npm2Q80W85 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Npm2Q80W85 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Npm2Q80W85 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Npm2Q80W85 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Npm2Q80W85 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Npm2Q80W85 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Npm2Q80W85 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Npm2Q80W85 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Npm2Q80W85 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Npm2Q80W85 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Npm2Q80W85 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Npm2Q80W85 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Npm2Q80W85 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
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