Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pnma8aQ80VM8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnma8aQ80VM8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma8aQ80VM8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms