Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM4

Znf579, Zinc finger protein 579, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf579Q80VM4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf579Q80VM4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf579Q80VM4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Znf579Q80VM4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Znf579Q80VM4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Znf579Q80VM4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Znf579Q80VM4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf579Q80VM4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf579Q80VM4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Znf579Q80VM4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf579Q80VM4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf579Q80VM4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf579Q80VM4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf579Q80VM4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf579Q80VM4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf579Q80VM4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms