Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rpp38Q80UU2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpp38Q80UU2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpp38Q80UU2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms