Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pja2Q80U04 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pja2Q80U04 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms