Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna12Q80SS5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms