Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcph1Q7TT79 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcph1Q7TT79 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mcph1Q7TT79 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcph1Q7TT79 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms