Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rexo1Q7TT28 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rexo1Q7TT28 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rexo1Q7TT28 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rexo1Q7TT28 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rexo1Q7TT28 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rexo1Q7TT28 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rexo1Q7TT28 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rexo1Q7TT28 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rexo1Q7TT28 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rexo1Q7TT28 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo1Q7TT28 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo1Q7TT28 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Rexo1Q7TT28 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms