Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcdh8Q7TSK3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pcdh8Q7TSK3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms