Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SugctQ7TNE1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SugctQ7TNE1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SugctQ7TNE1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SugctQ7TNE1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms