Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc6aQ78XR0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc6aQ78XR0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc6aQ78XR0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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