Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nme8Q715T0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Nme8Q715T0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms