Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Syne1Q6ZWR6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Syne1Q6ZWR6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Syne1Q6ZWR6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Syne1Q6ZWR6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Syne1Q6ZWR6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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