Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nemp1Q6ZQE4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nemp1Q6ZQE4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms