Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrn2Q6PHP6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrn2Q6PHP6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrn2Q6PHP6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrn2Q6PHP6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrn2Q6PHP6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrn2Q6PHP6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrn2Q6PHP6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrn2Q6PHP6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrn2Q6PHP6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrn2Q6PHP6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrn2Q6PHP6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms