Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc57Q6PHN1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc57Q6PHN1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc57Q6PHN1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms