Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc82Q6PG04 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms