Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ecm29Q6PDI5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ecm29Q6PDI5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ecm29Q6PDI5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms