Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SvoplQ6PDF3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SvoplQ6PDF3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms