Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gga2Q6P5E6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms